A pesar de las medidas del gobierno para mejorar las condiciones de los centros de recepción, e la Agencia de la ONU para los Refugiados recibió en 2017 denuncias sobre la existencia de más de 600 personas, en su mayoría mujeres y niñas, que habían sufrido algún tipo de violencia sexual o por motivos de género en las islas de Lesbos y Samos.